哈哈，这个问题有意思了，火影中佩恩那么厉害为何被鸣人打败了？个人认为与鸣人的主角光环以及佩恩经过大量消耗有关系，下面具体说明一下。

佩恩和鸣人相比在持久战能力上有差距，毕竟佩恩查克拉量没有鸣人那么多，经历过前面战斗的消耗，面对鸣人已经很难发挥轮回眼的技能优势。

剧情里边鸣人和佩恩的能力差距主要还是体现在查克拉量上，鸣人和佩恩的控制者长门都属于具备漩涡一族血统的角色，天生查克拉量就比较大，再加上鸣人体内还封印了半只九尾，对比之下佩恩的持久战能力和极限爆发能力并不能保证压制鸣人。而且鸣人经过剧情发展战斗模式也在进化，由早期的依靠螺旋丸＋多重影分身＋九尾化变成了仙人模式＋螺旋丸＋多重影分身＋九尾化，这一变化让佩恩更加难以应付。

而且佩恩由于是傀儡无法把所有轮回眼特殊能力综合运用，也让鸣人能够抓住机会各个击破，实际上鸣人遇到最难缠的轮回眼角色除了宇智波斑以外就是秽土转生状态的长门了。而佩恩入侵木叶村阶段一个佩恩只能使用轮回眼的一部分能力，这种情况下鸣人自然能够抓住机会把属于佩恩个体中辅助能力部分尽量破坏掉，留下来一个会控制引力场的天道佩恩。

这个阶段的天道佩恩已经消耗了大量的查克拉，很难维持巅峰状态，而鸣人则是以逸待劳各项能力都属于巅峰期，天道搞不定鸣人很正常。鸣人启动仙人模式以后力量，反应速度，感知能力都有极大的增幅，这种情况下天道佩恩想要单纯利用引力场收拾鸣人并不现实，而且经过木叶村忍者的试探基本上把佩恩能力优缺点摸的差不多了。这样一来鸣人在策略上就能够针对性的采取行动让佩恩的能力优势发挥不出来，后面鸣人还能够启动九尾爆发状态，对比之下双方查克拉极限爆发能力差距就比较明显了，此消彼长的情况下佩恩输是正常情况。

鸣人有各种主角光环的加持能够抵消不利的负面状态，但是控制佩恩的长门可没有这些优势，最后才会被鸣人的嘴遁解决掉。

客观来说鸣人和佩恩的对决并没有完全分出胜负，即使鸣人有九尾力量和仙人模式的扶持也没有做到完全压制佩恩。但是人家有主角光环啊，关键时刻就能够起作用让佩恩无可奈何。

这个阶段鸣人和九尾的关系比以前稍微融洽了一些，但是还是没有取得九尾完全的信任，因此鸣人依旧有失控的风险。在对决佩恩的过程中目睹自己亲朋好友惨状的鸣人就差点失去控制，不过依靠波风水门存留在鸣人体内的查克拉，还是能够避免九尾失控暴走的风险，也让天道佩恩耗费为数不多剩下查克拉释放都地爆天星功亏一篑。反过来鸣人的查克拉量也还能维持足够长的时间，而佩恩因为鸣人主角光环都存在无法对鸣人造成致命伤害。

再加上长门本身并不是一个极端的反派角色，还心存一点善意。鸣人的嘴遁才能够发挥作用，如果是换成宇智波斑这种立场坚定的角色估计还有得打，这种情况下经过大量消耗的长门拖的时间越长越没有优势。而按照原始剧情内容来说，佩恩的控制者并不是一个力场坚定的角色，这样才会被鸣人乘虚而入以嘴遁解决掉了长门。这也是鸣人才有点待遇，换成其他角色嘴遁就没有多少优势了。看看自来也苦口婆心劝说长门的例子就清楚了，鸣人最后能够解决掉佩恩多亏了技能配置优势和主角光环的双重加持。

最后总结一下，实际上佩恩输给鸣人的原因并不复杂，一方面是前期入侵木叶村的过程中已经让佩恩消耗大量查克拉，持久战能力上比不过鸣人。另一方面就是这一阶段的鸣人实力经过升级加上主角光环的加持能够让佩恩轮回眼优势发挥不出来，此消彼长的情况下佩恩输给鸣人是很正常的，分析不到位的地方请见谅，各位有其他想法欢迎留言讨论。

在火影忍者中佩恩也是非常厉害的一个忍者吧，因为他天赋实在是特别强悍，所以说很多人想要跟他决斗的时候都是输在了他的手下水，不过这也是心服口服吗？毕竟就是一个武力至上的世界，谁的力量强大？谁就是这个世界的最强尊者。

但是没想到最后就让鸣人打败了，佩恩，也是让大家觉得理所当然吧，又觉得鸣人的长进实在是太厉害了，那么他到底是怎么打败佩恩的呢？其实刚开始的时候听到就已经不能使用了，就剩下四个佩恩来守护者这个地方吧，然后后来等恢复的时候，他们还是不能用自己的武功就鸣人和蛤蟆能够用，所以是一种运气的加成吧，完全是因为侥幸，所以鸣人才打败了佩恩。

不过那个时候完全是他运气好吧，再加上他们无法使用自己最强大的力量来抵抗鸣人和蛤蟆的进攻，然后后来的时候名人更是靠着自己体内的九尾十话，然后扳成了一场所以才打败了黑暗，自此也是奠定了自己在火影世界里的名声吧，毕竟能够打败佩恩的都是特别厉害的人。

而且佩恩的定位，也就是人界和神界的一个分界点吧，人界都是打不过他，但是如果有外挂的话，或者是神界的人就会轻而易举的将它消灭，如果能打败他，还是证明了自己已经跨越了人界冲上了神界。

佩恩是由“晓”组织首领长门用轮回眼的能力所控制的六具尸体，由于长门行动不便而制造出来代替他的一切行动，主体为长门的挚友弥彦，能力来自长门，没有自我意识。总共对应这六道，天道、修罗道、人间道、畜生道（男畜生道、女畜生道）、饿鬼道、地狱道每一道能力各不相同。因此能力是非常强的，也是火影里面第一个属于大BOSS类型的。

至于为什么会败给鸣人，这个就要从佩恩从小说起。佩恩作为自来也的徒弟对于世界也是充满了憧憬和希望的，希望这个忍者世界变得和平。从佩恩控制的“晓”组织就知道，晓，字面的本意是拂晓，光明，而晓组织的目的却是将黑暗带给整个忍者世界，在他们眼里，旧的忍者五大国，与其被慢慢的改造发展，还不如彻底将其毁灭，重新打造他们眼中的新世界，这才是他们的拂晓，他们的希望。

到了后期由于晓的变化让佩恩感到和他的初衷已经背到而行了。所以在和鸣人交战后，觉得鸣人能够也有能力去改变这个黑暗的世界，能够继承自己的梦想。所以半推半就的败给了鸣人（主要鸣人的嘴遁太厉害了）。

鸣人能打败佩恩，我认为是多方面因素的结果，有鸣人自己的原因（比如请别忘了鸣人有强大的嘴遁），也有客观的原因。我们接下来来看看

既然我们要对比佩恩和漩涡鸣人，我们就有必要看看这两个人本来的力量差距。佩恩作为拥有轮回眼的BOSS级别的人物，在火影整个前中后期都算得上是排得上名号的人物。六个佩恩中最强的是天道，几个佩恩配合起来无论攻击防御都毫无死角，作为晓的战斗利器、几乎可以说同期也没有拿不下的人物。我们再看鸣人，虽然是主角，拥有强大的查克拉，但是如果没有以下几个因素的作用，我想他也是没法获胜的：

1. 鸣人在妙木山学会了仙术，拥有了仙人模式。从他学会仙人模式的那一刻起，他就已经在开挂的路上走得更加欢快了！仙人模式的感知能力、体术对抗能力、蛙组手等能力是鸣人能打败佩恩天道的重要因素，可以说如果让没有轮回眼的佩恩和仙人鸣人单挑体术，佩恩没有胜算。
   

2. 漩涡鸣人在和六道佩恩战斗时，已经拥有了几个佩恩能力方面的信息和情报。这些情报都是已经战斗逝去的同伴、老师们浴血奋战的结果。鸣人拥有了这些情报当然会容易一些，可以不用做一些无用功。

3. 鸣人体内有九尾做BUFF的加持。鸣人体内有九尾，查克拉的补充速度、受伤后的愈合速度等都远不是常人可以比的，特别是面对佩恩这种地狱级别的对手，这时候就要体现出九尾的优势。

4. 漩涡鸣人作为主角，由他最后来打败佩恩可以升华主题，让事情的发展更有意义。鸣人的终极绝招就是嘴遁，如果万一实力不够，嘴遁就行了。长门是鸣人的师兄，作为师兄弟，两个人最后也真正互相理解了，这样主题就升华了。

从上面的因素看来，鸣人能够打败佩恩确实也是多方面的因素作用的结果。说到嘴遁，我觉得火影忍者与其他动漫很大的一点不同就是：打不赢要用嘴遁，打得赢也要用嘴遁！大家觉得有道理吗？

鸣人因为从小就有当火影的梦想，当火影就该有为村子付出和牺牲的觉悟，他也是对木叶村有深厚感情的人，鸣人也知道佩恩此行就是要灭绝木叶，靠着九尾暴走才打败了佩因，还找到本体长门，并用嘴遁说服对方，长门使用轮回天生之术复活了这场战斗中被他杀掉的人。